學院擁有水利機械二級學科博士點。機械工程一級學科碩士點、材料加工工程二級學科學術型碩士點,具有機械工程、工業設計工程兩個領域的專業碩士學位授予權。設有機械工程、能源與動力工程、金屬材料工程、工業設計四個本科專業。機械工程在“十五”、“十一五”和“十二五”期間均被列為校級重點學科。2011年機械工程專業入選首批教育部“卓越工程師”培養計劃。機械電子工程為水利部重點學科。
學院以機械工程學科為引領,堅持“入主流,有特色”這一發展思路,立足機械工程傳統學科方向與國内外學科發展前沿,緊密圍繞國家與地區社會經濟發展及水利行業的重大需求,綜合基礎理論研究、工程應用與服務社會發展,形成如下學科研究方向:現代機械設計及理論、疏浚裝備與疏浚技術、機電控制與機器人技術、水工金屬結構設計與制造、熱能工程及太陽能熱利用、太陽能光伏利用技術、焊接自動化、機器人化和智能化技術、先進焊接和表面改性技術、人機系統及人機交互設計、産品設計及可用性評價等。